不同组织形式的企业在税收方面有着不同的特点，投资者对企业不同组织形式的选择，其投资收益也将产生差别，进而影响企业的整体税收和获利能力。因此，在企业设立之时，很有必要在组织形式的选择上进行一番积极重庆税收筹划。

我国对公司企业和合伙企业实行不同的纳税规定。国家对公司营业利润在企业环节上课征公司税，税后利润作为股息分配给投资者，个人投资者还需要缴纳一次个人所得税。而合伙企业则不然，营业利润不交公司税，只课征合伙人分得收益的个人所得税。

在不考虑其主要因素的情况下，单就合伙企业和股份有限公司而言，合伙企业要优于股份有限公司，因为合伙企业只征一次个人所得税，而股份有限公司还要再征一次企业所得税，如果综合考虑企业的税基、税率、优惠政策等多种因素的存在，股份有限公司也是有利的一面，因为，国家的税收优惠政策一般都是只为股份有限公司所适用。

其次，在测算两种性质企业的税后整体利益时，不能只看名义税率，还要看整体税率， 由于股份有限公司的“ 整体化”措施一般情况下要优于合伙制企业，“整体化”就意味着重叠课征的消除，税收便会消除一部分。

第三，如合伙人中既有本国居民，又有外国居民，就出现了合伙企业的跨国税收现象，由于国藉的不同，税收将出现差异。一般情况下，规模较大企业应选择股份有限公司，规模不大的企业，采用合伙企业比较合适。

此时，当一个企业要进行跨地区经营时，常见的做法就是在其它地区设立下属机构，即开办子公司或分公司，从法律上讲，子公司属于独立法人，而分公司则不属于独立法人，它们之间的不同在于：一是设立手续不同，在外地创办独立核算子公司，需要办理许多手续，设立程序复杂，开办费用也较大，而设立分公司的程序比较简单，费用开支比较少。

另外，核算和纳税形式不同。子公司是独立核算并独立申报纳税，当地税务机关比较喜欢，而分公司不是独立法人，由总公司进行核算盈亏和统一纳税，如有盈亏，分公司和总公司可以相互抵扣后才交纳所得税。